पशु सूक्ष्म जैविकी (Veterinary Microbiology) घरेलु पसुओं में जीवाणु एवं विषाणु से होने वाली बीमारियों से संबंधित विज्ञान है। यह सूक्ष्मजैविकी की एक शाखा है।