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वाहन पंजीकरण (vehicle registration) से आशय किसी सरकारी प्राधिकारी के यहाँ वाहन का पंजीकरण कराने से है। अधिकांश देशों में सड़क पर चलने वाले इंजनचालित वाहनों का पंजीकरण कराना अनिवार्य है। वाहन पंजीकरण का उद्देश्य किसी वाहन तथा उसके मालिक/चालक के बीच कड़ी स्थापित करना है। इसका उपयोग कराधान के लिए या अपराध की रोकथाम के लिए किया जा सकता है।

प्रायः सभी मोटर वाहनों को एक अद्वितीय पहचान संख्या दी जाती है।