[[File:EscherichiaColi NIAID.jpg|thumb|280px|एशेरिकिया कोलाए ([Escherichia coli) [[होमो सेपियन्स|मानवों]] के [[जठरांत्र क्षेत्र]] में रहने वाली [[जीवाणु|बैक्टीरिया]] की कई जातियों में से एक है]]
'''जठरांत्र सूक्ष्मवनस्पति''' (gut microflora) या '''जठरांत्र वनस्पति''' (gut flora) या '''जठरांत्र सूक्ष्मबायोटा''' (gut microbiota) [[होमो सेपियन्स|मानवों]] व अन्य [[प्राणी|प्राणियों]] के [[जठरांत्र क्षेत्र]] (आँत इत्यादि) में रहने वाली [[सूक्ष्मजीवीसूक्ष्मजीव]]ी [[जीववैज्ञानिक जाति (जीवविज्ञान)|जातियों]] को सामूहिक रूप से कहा जाता है। मानवों और उनमें रहने वाले सूक्ष्मजीविओं में आपसी [[पारस्परण (जीवविज्ञान)|पारस्परण]] का सम्बन्ध होता है। उदाहरण के लिए कुछ जातियाँ [[आहारीय रेशा|आहारीय रेशों]] का [[किण्वन]] द्वारा [[पाचन]] करने में सहायक होती हैं जबकि उन्हें भी इसके द्वारा अपना आहार मिलता है।<ref name=Saxena2016>{{cite book |chapter=A Metagenomic Insight Into the Human Microbiome: Its Implications in Health and Disease|last=Saxena|first=R. |last2=Sharma|first2=V.K| editor1=D. Kumar | editor2= S. Antonarakis | title=Medical and Health Genomics | publisher=Elsevier Science | year=2016 | isbn=978-0-12-799922-7 | url=https://books.google.com/books?id=3ylOBQAAQBAJ&pg=PA117 | doi=10.1016/B978-0-12-420196-5.00009-5 | page=117}}</ref><ref name=Quigley2013rev>{{cite journal |pmid=24729765 |pmc=3983973 |year=2013 |author1=Quigley |first1=E. M |title=Gut bacteria in health and disease |journal=Gastroenterology & hepatology |volume=9 |issue=9 |pages=560–9 }}</ref>
