समुद्री पुरातत्व (Maritime archaeology या marine archaeology), पुरातत्व की एक शाखा है जो प्राचीन मानव का समुद्रों, झीलों एवं नदियों से सम्बन्धित क्रियाकलापों का अध्ययन करती है। इस कार्य में प्राचीन जलयान, समुद्र के किनारे स्थित बन्दरगाह एवं अन्य निर्माण, डूबे हुए लैण्डस्केप आदि बहुत सहायक होते हैं।