सूक्ष्मतरंग कोटर (microwave cavity) या रेडियो आवृत्ति कोटर (radio frequency cavity) एक विशेष प्रकार का अनुनादक (resonator) होता है जो बन्द या अधिकांशतः बन्द धातु का बना होता है जिसमें विद्युतचुम्बकीय क्षेत्र निर्मित होते हैं। सूक्ष्मतरंग कोटर या तो खोखला होता है या इसमें कोई परावैद्युत पदार्थ भरा होता है।

१९५५ में निर्मित दो सूक्ष्मतरंग कोटर, जिनमें तरंगपथक (waveguide) जुड़े हुए हैं।